如果使用星通宝POS机签到时提示"E1-未知返回码"，可能是由以下原因导致的：终端入库错误，或者内部机身号与后台入库不一致。

下面是详细的处理步骤。

1、检查终端入库

首先需要检查终端入库是否有误。可能是机身号输入错误或者出现其他问题，导致终端无法正常进行签到。如果发现入库错误，需要重新入库正确的机身号（背面完整序列号）。

2、核实内部机身号与后台入库是否一致

如果终端入库正确，还需要核实内部机身号与后台入库是否一致。可能是出现了数据同步问题或者其他原因导致内部机身号与后台入库的机身号不一致，从而导致无法进行正常的签到操作。需要检查内部机身号与后台入库的机身号是否一致，并进行必要的调整和更改。

3、重新签到

在确认终端入库正确，内部机身号与后台入库一致之后，需要重新进行签到操作。如果签到成功，说明问题已经解决。如果签到仍然失败，可能是其他原因导致，需要进一步排查问题。

综上所述，如果使用星通宝POS机签到时提示"E1-未知返回码"，可能是由终端入库错误或者内部机身号与后台入库不一致导致的。需要检查终端入库是否有误，并核实内部机身号与后台入库是否一致。如果问题仍然存在，需要进一步排查原因，以解决问题。